El objetivo fundamental del GAPBilbao es tener un grupo representativo del sector logístico/portuario, que marque las directrices de desarrollo de la plataforma e-puertobilbao.
En definitiva, el GAPBilbao sostiene cuatro objetivos principales:

Proponer y consensuar: las mejoras sobre la cadena de actividad de la logística portuaria.
Crear acuerdos: entre todas las organizaciones usuarias, con el ánimo de consolidar compromisos que permitan que la nueva plataforma se constituya como el referente para el intercambio de información por medios electrónicos en el Puerto de Bilbao.
Consolidar: líneas de actuación que faciliten la transición al cambio de los agentes portuarios.
Promover y monitorizar: la utilización de la plataforma e-puertobilbao como herramienta soporte de los procesos que conforman la cadena de actividad logística portuaria.