Nace en el año 2000 como primera reacción a la iniciativa e-puertobilbao presentada por la Autoridad Portuaria de Bilbao a los agentes portuarios y se conforma con la participación de los principales agentes privados e instituciones públicas implicados directa o indirectamente en la actividad de la logística portuaria de Bilbao.
El GAPBilbao es un grupo de trabajo representativo y de referencia en el Puerto de Bilbao para la definición, el establecimiento y la mejora continua de los procedimientos que regulan la cadena de actividad de la logística portuaria, para su posterior implantación en forma de servicios telemáticos en la plataforma e-puertobilbao.
Además, actúa como catalizador a una serie de sensibilidades que, aunque originadas de forma separada y espontánea desde diversos sectores de la actividad portuaria, confluyen posteriormente en unas demandas y expectativas consolidadas desde el seno de la comunidad de usuarios del Puerto de Bilbao en la plataforma e-puertobilbao.